A templomot 1738-ban építették Szentendre pravoszláv vallású új lakói, a Szentlélek eljövetelének tiszteletére.
A XX. század elejére az izbégi pravoszláv egyházközség tagjai annyira megfogyatkoztak, hogy már nem volt szükségük a templomra. Már 1928-ban felmerült az a gondolat, hogy a katolikusok megvásárolják. 1946-ban Mindszenty József hercegprímás, esztergomi érsek vetette fel, hogy szerveződjön Izbégen káplánság. Sok-sok nehézséggel megküzdve, végül 1948. január 30-án a Szentendre-Izbég Római Katolikus Egyházközség megvásárolta a templomot, amelyet a Historia Domus bejegyzése szerint Mindszenty József 1948. október
